洞庭湖生態經濟區建設行動計劃要求，要推進生態文明建設。

   開展百湖濕地修復與保護工程，被列為“511”重大項目生態環保類的第一個。這項工程重點對區域內面積在1平方公里以上的96個湖泊的生態環境進行修復與保護，加強濕地保護與管理能力建設，保護良好的濕地生態系統和生物多樣性。主要建設內容為濕地恢復與治理、濕地基礎設施建設、濕地科研監測能力建設、宣教設施建設以及濕地保護管理工程建設等。

   生物多樣性保護方面，行動計劃提出要設立洞庭湖濕地公園，通過濕地植被補植補造等措施，恢復植被種類和植被群落，對珍稀濕地動物江豚、中華鱘、白頭鶴等棲息地進行修復。要修復重建已破壞的重要候鳥棲息地和遷徙停歇地、珍稀魚類重要產卵區，洄游通道及重要漁業水域等生態敏感區域。到2018年，江豚、中華鱘等保護動物的棲息地要達到基本恢復。

   與此同時，區域內還將新建、改建、擴建高速公路兩旁20-30米，國道、省道、鐵路等交通干線兩旁5-10米，縣鄉道路線路有條件的地段全面建成沿線綠化帶，形成生態廊道。

   計劃到2016年，新增綠化總面積6萬公頃，湖區綠色生態廊道比例達到80%，2018年實現連綿山體、主要江河兩岸及交通主干線兩側等重點區域生態廊道全覆蓋。

   此外，還要實施雨污分流排水管網建設工程、再生水回用工程、餐廚廢棄物資源化無害化工程等城市生態工程建設，提質改造一批城區污水處理廠，加快實施農村河道清理。

   到2016年，90%的城鄉河道水質標準達Ⅲ類以上，區域內所有縣城建成垃圾、污水處理設施。